自2009年體制改革，東海水產研究所后勤處成立，主要負責車隊管理及使用、物資采購和倉管、研究生宿舍管理、設施管理及維修、公務及會務接待、環衛綠化養護、研究所本部物業管理、安全保衛、體檢獻血及職工子女福利管理等跟科研事業息息相關的各方面工作，為我所和諧穩定發展肩負了平凡而又重要的使命。
近幾年來，后勤處加強管理，注重文明建設，后勤人員素質有了普遍提高，目前后勤處共有工作人員 31 人，分別中級職稱10人、高級工 3 名、中級工 19 名。 連續多年榮獲“上海市楊浦區安全行車先進集體”、“愛國衛生合格單位”“楊浦區企事業單位獻血工作考核優秀集體”等光榮稱號。
一直以來，后勤處全體工作人員以“走進科研服務科研”為工作宗旨，通過技術學習、制度完善、信息溝通、團隊建設等各種措施，提高部門業務能力，為我所科研工作提供了長期穩定的后勤保障，使我所進一步地發展為節能型、高效型、綜合型水產研究所作出應有的貢獻。
